grep chkc /etc/rc.d/init.d/NetworkManager 13:01 # chkconfig: - 98 02 02 для STOP - это очень рано. Надо стопить вместе с сервисом network, т.е. после отмонтирования netfs и т.п.
В NetworkManager-0.7.0-alt15 поставил 40 90. Но если соединение создано в nm-applet или knetworkmanager, то оно все равно порвется при выходе апплета. Не зависят от них только соединения, прочитанные из etcnet или сделанные Available for all users в nm-applet. Также и подключение по ним будет сразу при старте NM.